Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os01g67640.1LOC_Os01g67640
LOC_Os01g67630.2LOC_Os01g67630
LOC_Os01g67630.1LOC_Os01g67630
LOC_Os07g01070.1LOC_Os07g01070
LOC_Os01g04950.1LOC_Os01g04950
LOC_Os01g04950.3LOC_Os01g04950
LOC_Os01g04950.2LOC_Os01g04950
LOC_Os12g13790.1LOC_Os12g13790
LOC_Os04g50930.1LOC_Os04g50930
LOC_Os10g42900.1LOC_Os10g42900
LOC_Os10g42870.2LOC_Os10g42870
LOC_Os10g42870.1LOC_Os10g42870
LOC_Os07g41250.2LOC_Os07g41250
LOC_Os07g41250.1LOC_Os07g41250
LOC_Os02g47090.1LOC_Os02g47090
LOC_Os04g50950.1LOC_Os04g50950
LOC_Os04g50940.2LOC_Os04g50940
LOC_Os04g50940.1LOC_Os04g50940
LOC_Os10g02080.1LOC_Os10g02080
LOC_Os03g51050.1LOC_Os03g51050
LOC_Os03g13274.3LOC_Os03g13274
LOC_Os03g13274.2LOC_Os03g13274
LOC_Os03g13274.1LOC_Os03g13274
LOC_Os03g13274.4LOC_Os03g13274
LOC_Os10g02100.2LOC_Os10g02100
LOC_Os10g02100.1LOC_Os10g02100
LOC_Os10g02340.1LOC_Os10g02340
LOC_Os10g02240.1LOC_Os10g02240
LOC_Os10g02260.2LOC_Os10g02260
LOC_Os10g02260.1LOC_Os10g02260
LOC_Os10g02220.5LOC_Os10g02220
LOC_Os10g02220.4LOC_Os10g02220
LOC_Os10g02220.3LOC_Os10g02220
LOC_Os10g02220.2LOC_Os10g02220
LOC_Os10g02220.1LOC_Os10g02220
LOC_Os10g22560.3LOC_Os10g22560
LOC_Os10g22560.2LOC_Os10g22560
LOC_Os10g22560.1LOC_Os10g22560
LOC_Os10g02210.1LOC_Os10g02210
LOC_Os06g49220.1LOC_Os06g49220
LOC_Os06g49250.2LOC_Os06g49250
LOC_Os06g49250.1LOC_Os06g49250
LOC_Os06g49250.3LOC_Os06g49250
LOC_Os06g49250.5LOC_Os06g49250
LOC_Os06g49250.4LOC_Os06g49250
LOC_Os03g13250.1LOC_Os03g13250
LOC_Os03g13240.2LOC_Os03g13240
LOC_Os03g13240.1LOC_Os03g13240
LOC_Os02g48570.2LOC_Os02g48570
LOC_Os02g48570.1LOC_Os02g48570
LOC_Os02g46460.2LOC_Os02g46460
LOC_Os02g46460.1LOC_Os02g46460
LOC_Os05g27304.1LOC_Os05g27304
LOC_Os12g44100.1LOC_Os12g44100
LOC_Os03g48180.1LOC_Os03g48180
LOC_Os04g56560.1LOC_Os04g56560
LOC_Os01g68510.1LOC_Os01g68510
LOC_Os01g55600.1LOC_Os01g55600
LOC_Os01g55610.1LOC_Os01g55610
LOC_Os11g23890.1LOC_Os11g23890
LOC_Os06g15370.1LOC_Os06g15370
LOC_Os05g34030.1LOC_Os05g34030
LOC_Os05g34010.1LOC_Os05g34010
LOC_Os05g34000.1LOC_Os05g34000
LOC_Os05g33960.1LOC_Os05g33960
LOC_Os01g01360.1LOC_Os01g01360
LOC_Os03g48180.2LOC_Os03g48180
LOC_Os01g04950.4LOC_Os01g04950
LOC_Os04g39030.1LOC_Os04g39030
LOC_Os02g37040.1LOC_Os02g37040
LOC_Os08g05910.2LOC_Os08g05910
LOC_Os08g05910.1LOC_Os08g05910
LOC_Os10g40600.1LOC_Os10g40600
LOC_Os03g01290.1LOC_Os03g01290
LOC_Os01g37590.2LOC_Os01g37590
LOC_Os01g37590.1LOC_Os01g37590
LOC_Os11g12740.1LOC_Os11g12740
LOC_Os04g36040.1LOC_Os04g36040
LOC_Os06g38294.1LOC_Os06g38294
LOC_Os04g41450.1LOC_Os04g41450
LOC_Os04g41400.1LOC_Os04g41400
LOC_Os04g41410.1LOC_Os04g41410
LOC_Os12g12934.1LOC_Os12g12934
LOC_Os11g17970.1LOC_Os11g17970
LOC_Os11g18110.1LOC_Os11g18110
LOC_Os11g18044.1LOC_Os11g18044
LOC_Os05g27010.1LOC_Os05g27010
LOC_Os10g33210.1LOC_Os10g33210
LOC_Os10g33170.1LOC_Os10g33170
LOC_Os03g04570.1LOC_Os03g04570
LOC_Os01g28980.1LOC_Os01g28980
LOC_Os03g60850.1LOC_Os03g60850
LOC_Os06g13200.1LOC_Os06g13200
LOC_Os06g13210.2LOC_Os06g13210
LOC_Os06g13210.1LOC_Os06g13210
LOC_Os08g41590.1LOC_Os08g41590
LOC_Os04g59480.1LOC_Os04g59480
LOC_Os08g41600.1LOC_Os08g41600
LOC_Os01g65110.1LOC_Os01g65110
LOC_Os01g65100.1LOC_Os01g65100
LOC_Os01g65100.3LOC_Os01g65100
LOC_Os01g65100.2LOC_Os01g65100
LOC_Os05g35594.1LOC_Os05g35594
LOC_Os05g35650.2LOC_Os05g35650
LOC_Os05g35650.1LOC_Os05g35650
LOC_Os01g65210.1LOC_Os01g65210
LOC_Os01g65200.2LOC_Os01g65200
LOC_Os01g65200.1LOC_Os01g65200
LOC_Os01g65200.3LOC_Os01g65200
LOC_Os01g65120.1LOC_Os01g65120
LOC_Os10g05780.1LOC_Os10g05780
LOC_Os01g65190.1LOC_Os01g65190
LOC_Os01g65169.1LOC_Os01g65169
LOC_Os01g65140.1LOC_Os01g65140
LOC_Os01g65150.1LOC_Os01g65150
LOC_Os10g02230.1LOC_Os10g02230
LOC_Os01g65130.1LOC_Os01g65130