Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os05g25550.2LOC_Os05g25550
LOC_Os05g25550.1LOC_Os05g25550
LOC_Os02g55400.1LOC_Os02g55400
LOC_Os04g56160.3LOC_Os04g56160
LOC_Os04g56160.2LOC_Os04g56160
LOC_Os04g56160.1LOC_Os04g56160
LOC_Os03g01120.1LOC_Os03g01120
LOC_Os07g09340.1LOC_Os07g09340
LOC_Os03g48310.1LOC_Os03g48310
LOC_Os12g44150.2LOC_Os12g44150
LOC_Os12g44150.1LOC_Os12g44150
LOC_Os03g08560.1LOC_Os03g08560
LOC_Os02g57920.1LOC_Os02g57920
LOC_Os11g29750.1LOC_Os11g29750
LOC_Os11g29490.3LOC_Os11g29490
LOC_Os11g29490.2LOC_Os11g29490
LOC_Os11g29490.1LOC_Os11g29490
LOC_Os03g52090.1LOC_Os03g52090
LOC_Os03g17310.1LOC_Os03g17310
LOC_Os05g02940.2LOC_Os05g02940
LOC_Os05g02940.1LOC_Os05g02940
LOC_Os10g28240.1LOC_Os10g28240
LOC_Os08g40530.2LOC_Os08g40530
LOC_Os08g40530.1LOC_Os08g40530
LOC_Os02g08010.1LOC_Os02g08010
LOC_Os04g51610.3LOC_Os04g51610
LOC_Os04g51610.1LOC_Os04g51610
LOC_Os03g10640.1LOC_Os03g10640
LOC_Os12g39660.1LOC_Os12g39660
LOC_Os03g42020.1LOC_Os03g42020
LOC_Os05g41580.1LOC_Os05g41580
LOC_Os12g04220.1LOC_Os12g04220
LOC_Os11g04460.1LOC_Os11g04460
LOC_Os01g71240.1LOC_Os01g71240
LOC_Os10g27220.2LOC_Os10g27220
LOC_Os10g27220.1LOC_Os10g27220
LOC_Os06g36990.1LOC_Os06g36990
LOC_Os08g29150.1LOC_Os08g29150
LOC_Os06g29380.1LOC_Os06g29380
LOC_Os05g01030.1LOC_Os05g01030
LOC_Os03g20970.2LOC_Os03g20970
LOC_Os03g20970.1LOC_Os03g20970
LOC_Os01g17010.1LOC_Os01g17010
LOC_Os03g20949.2LOC_Os03g20949
LOC_Os03g20949.1LOC_Os03g20949
LOC_Os03g21680.1LOC_Os03g21680
LOC_Os03g21680.2LOC_Os03g21680
LOC_Os03g21680.4LOC_Os03g21680
LOC_Os03g21680.3LOC_Os03g21680
LOC_Os04g28460.1LOC_Os04g28460
LOC_Os11g25980.2LOC_Os11g25980
LOC_Os11g25980.1LOC_Os11g25980
LOC_Os05g33390.1LOC_Os05g33390
LOC_Os07g12900.1LOC_Os07g12900
LOC_Os02g07630.1LOC_Os02g07630
LOC_Os04g46940.1LOC_Os04g46940
LOC_Os02g10290.1LOC_Os02g10290
LOC_Os08g37950.1LOC_Os08g37950
LOC_Os03g08070.3LOC_Os03g08070
LOC_Os03g08070.2LOC_Os03g08070
LOC_Os03g08070.1LOC_Os03g08070