Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os12g42130.1LOC_Os12g42130
LOC_Os07g33310.1LOC_Os07g33310
LOC_Os03g37640.2LOC_Os03g37640
LOC_Os03g37640.1LOC_Os03g37640
LOC_Os03g37470.1LOC_Os03g37470
LOC_Os03g37490.1LOC_Os03g37490
LOC_Os03g37411.1LOC_Os03g37411
LOC_Os08g44870.1LOC_Os08g44870
LOC_Os08g44870.3LOC_Os08g44870
LOC_Os08g44870.2LOC_Os08g44870
LOC_Os02g57580.1LOC_Os02g57580
LOC_Os02g57570.1LOC_Os02g57570
LOC_Os10g20380.1LOC_Os10g20380
LOC_Os03g08900.1LOC_Os03g08900
LOC_Os09g29284.1LOC_Os09g29284
LOC_Os08g37432.2LOC_Os08g37432
LOC_Os08g37432.1LOC_Os08g37432
LOC_Os12g03260.1LOC_Os12g03260
LOC_Os11g03500.1LOC_Os11g03500
LOC_Os12g03200.3LOC_Os12g03200
LOC_Os12g03200.2LOC_Os12g03200
LOC_Os12g03200.1LOC_Os12g03200
LOC_Os12g03240.1LOC_Os12g03240
LOC_Os11g03484.1LOC_Os11g03484
LOC_Os12g03230.1LOC_Os12g03230
LOC_Os11g03240.1LOC_Os11g03240
LOC_Os08g43654.1LOC_Os08g43654
LOC_Os01g56050.1LOC_Os01g56050
LOC_Os10g11860.1LOC_Os10g11860
LOC_Os03g42830.1LOC_Os03g42830
LOC_Os07g31884.1LOC_Os07g31884
LOC_Os07g01750.1LOC_Os07g01750
LOC_Os06g49310.2LOC_Os06g49310
LOC_Os06g49310.1LOC_Os06g49310
LOC_Os06g29950.1LOC_Os06g29950
LOC_Os06g29994.1LOC_Os06g29994
LOC_Os10g11354.1LOC_Os10g11354
LOC_Os04g30490.1LOC_Os04g30490
LOC_Os10g20470.1LOC_Os10g20470
LOC_Os10g20350.2LOC_Os10g20350
LOC_Os10g20350.1LOC_Os10g20350
LOC_Os10g20390.1LOC_Os10g20390
LOC_Os10g20450.1LOC_Os10g20450
LOC_Os01g49120.1LOC_Os01g49120
LOC_Os05g48040.1LOC_Os05g48040
LOC_Os05g48040.3LOC_Os05g48040
LOC_Os05g48040.4LOC_Os05g48040
LOC_Os05g48040.2LOC_Os05g48040
LOC_Os01g31980.2LOC_Os01g31980
LOC_Os01g31980.1LOC_Os01g31980
LOC_Os03g64150.1LOC_Os03g64150
LOC_Os12g36660.1LOC_Os12g36660
LOC_Os03g62270.1LOC_Os03g62270
LOC_Os03g12790.1LOC_Os03g12790
LOC_Os06g36330.1LOC_Os06g36330
LOC_Os09g35600.1LOC_Os09g35600
LOC_Os08g43250.1LOC_Os08g43250
LOC_Os10g37920.1LOC_Os10g37920
LOC_Os04g48290.1LOC_Os04g48290
LOC_Os02g45380.1LOC_Os02g45380
LOC_Os09g37610.1LOC_Os09g37610
LOC_Os12g01580.2LOC_Os12g01580
LOC_Os12g01580.1LOC_Os12g01580
LOC_Os10g13940.1LOC_Os10g13940
LOC_Os03g11734.2LOC_Os03g11734
LOC_Os03g11734.1LOC_Os03g11734
LOC_Os03g11734.3LOC_Os03g11734
LOC_Os01g69010.1LOC_Os01g69010
LOC_Os12g25160.1LOC_Os12g25160
LOC_Os12g06050.1LOC_Os12g06050
LOC_Os02g02980.2LOC_Os02g02980
LOC_Os02g02980.1LOC_Os02g02980