Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os09g36930.1LOC_Os09g36930
LOC_Os04g16450.1LOC_Os04g16450
LOC_Os04g47220.1LOC_Os04g47220
LOC_Os02g57720.1LOC_Os02g57720
LOC_Os02g44630.1LOC_Os02g44630
LOC_Os02g44630.2LOC_Os02g44630
LOC_Os02g44630.3LOC_Os02g44630
LOC_Os07g26640.1LOC_Os07g26640
LOC_Os07g26630.1LOC_Os07g26630
LOC_Os04g44060.1LOC_Os04g44060
LOC_Os02g41860.2LOC_Os02g41860
LOC_Os02g41860.1LOC_Os02g41860
LOC_Os02g41860.4LOC_Os02g41860
LOC_Os02g41860.3LOC_Os02g41860
LOC_Os07g26690.2LOC_Os07g26690
LOC_Os07g26690.1LOC_Os07g26690
LOC_Os10g34000.1LOC_Os10g34000
LOC_Os03g64330.1LOC_Os03g64330
LOC_Os04g46490.1LOC_Os04g46490
LOC_Os10g35050.1LOC_Os10g35050
LOC_Os04g44570.1LOC_Os04g44570
LOC_Os03g05290.1LOC_Os03g05290
LOC_Os01g74450.1LOC_Os01g74450
LOC_Os05g14240.2LOC_Os05g14240
LOC_Os05g14240.1LOC_Os05g14240
LOC_Os01g13130.1LOC_Os01g13130
LOC_Os01g13120.1LOC_Os01g13120
LOC_Os06g22960.1LOC_Os06g22960
LOC_Os02g44080.1LOC_Os02g44080
LOC_Os03g20410.1LOC_Os03g20410
LOC_Os01g08660.1LOC_Os01g08660
LOC_Os06g35930.1LOC_Os06g35930
LOC_Os02g13870.1LOC_Os02g13870
LOC_Os01g10600.1LOC_Os01g10600
LOC_Os05g11560.2LOC_Os05g11560
LOC_Os05g11560.1LOC_Os05g11560
LOC_Os10g36924.1LOC_Os10g36924
LOC_Os08g05580.1LOC_Os08g05580
LOC_Os12g10280.1LOC_Os12g10280
LOC_Os08g05600.1LOC_Os08g05600
LOC_Os08g05590.1LOC_Os08g05590
LOC_Os01g02190.1LOC_Os01g02190
LOC_Os06g12310.1LOC_Os06g12310
LOC_Os02g51110.1LOC_Os02g51110
LOC_Os01g10530.1LOC_Os01g10530
LOC_Os01g10530.2LOC_Os01g10530
LOC_Os01g10530.3LOC_Os01g10530