Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os03g02380.2LOC_Os03g02380
LOC_Os10g37520.2LOC_Os10g37520
LOC_Os10g37520.1LOC_Os10g37520
LOC_Os03g02380.1LOC_Os03g02380
LOC_Os12g03860.7LOC_Os12g03860
LOC_Os12g03860.2LOC_Os12g03860
LOC_Os12g03860.6LOC_Os12g03860
LOC_Os12g03860.1LOC_Os12g03860
LOC_Os12g03860.3LOC_Os12g03860
LOC_Os12g03860.4LOC_Os12g03860
LOC_Os11g04030.2LOC_Os11g04030
LOC_Os11g04030.4LOC_Os11g04030
LOC_Os11g04030.1LOC_Os11g04030
LOC_Os11g04030.3LOC_Os11g04030
LOC_Os12g03830.1LOC_Os12g03830
LOC_Os11g04020.1LOC_Os11g04020
LOC_Os12g03870.1LOC_Os12g03870
LOC_Os11g04060.1LOC_Os11g04060
LOC_Os12g03899.3LOC_Os12g03899
LOC_Os12g03899.2LOC_Os12g03899
LOC_Os11g04104.2LOC_Os11g04104
LOC_Os11g04104.1LOC_Os11g04104
LOC_Os12g03899.1LOC_Os12g03899
LOC_Os12g03899.4LOC_Os12g03899
LOC_Os11g04104.3LOC_Os11g04104
LOC_Os12g03950.1LOC_Os12g03950
LOC_Os11g04150.1LOC_Os11g04150
LOC_Os01g17214.1LOC_Os01g17214
LOC_Os01g16260.2LOC_Os01g16260
LOC_Os01g16260.3LOC_Os01g16260
LOC_Os01g16260.1LOC_Os01g16260
LOC_Os12g03860.5LOC_Os12g03860
LOC_Os11g05390.1LOC_Os11g05390
LOC_Os02g44730.1LOC_Os02g44730
LOC_Os12g44070.1LOC_Os12g44070
LOC_Os12g44060.1LOC_Os12g44060
LOC_Os03g47810.1LOC_Os03g47810
LOC_Os10g08850.1LOC_Os10g08850
LOC_Os07g09010.1LOC_Os07g09010
LOC_Os12g29950.2LOC_Os12g29950
LOC_Os12g29950.1LOC_Os12g29950
LOC_Os03g58580.1LOC_Os03g58580
LOC_Os12g44180.1LOC_Os12g44180
LOC_Os08g42010.1LOC_Os08g42010
LOC_Os04g31924.1LOC_Os04g31924
LOC_Os09g36600.2LOC_Os09g36600
LOC_Os09g36600.1LOC_Os09g36600
LOC_Os04g42420.3LOC_Os04g42420
LOC_Os04g42420.2LOC_Os04g42420
LOC_Os04g42420.1LOC_Os04g42420
LOC_Os06g08110.1LOC_Os06g08110
LOC_Os08g15450.1LOC_Os08g15450
LOC_Os07g38400.1LOC_Os07g38400
LOC_Os09g38690.1LOC_Os09g38690
LOC_Os09g38690.2LOC_Os09g38690
LOC_Os09g38690.4LOC_Os09g38690
LOC_Os09g38690.3LOC_Os09g38690
LOC_Os04g51970.2LOC_Os04g51970
LOC_Os04g51970.1LOC_Os04g51970
LOC_Os03g43720.3LOC_Os03g43720
LOC_Os03g43720.2LOC_Os03g43720
LOC_Os03g43720.1LOC_Os03g43720
LOC_Os03g43720.4LOC_Os03g43720
LOC_Os03g43720.5LOC_Os03g43720
LOC_Os03g43720.6LOC_Os03g43720
LOC_Os03g43720.7LOC_Os03g43720
LOC_Os04g53930.2LOC_Os04g53930
LOC_Os04g53930.1LOC_Os04g53930
LOC_Os07g37454.1LOC_Os07g37454
LOC_Os01g22710.1LOC_Os01g22710
LOC_Os07g37510.1LOC_Os07g37510
LOC_Os01g10240.1LOC_Os01g10240
LOC_Os07g37530.2LOC_Os07g37530
LOC_Os07g37530.1LOC_Os07g37530
LOC_Os04g44430.1LOC_Os04g44430
LOC_Os05g50280.1LOC_Os05g50280
LOC_Os05g49270.1LOC_Os05g49270
LOC_Os05g49260.1LOC_Os05g49260
LOC_Os11g42430.1LOC_Os11g42430
LOC_Os03g24870.1LOC_Os03g24870
LOC_Os03g24860.1LOC_Os03g24860
LOC_Os10g42830.1LOC_Os10g42830
LOC_Os03g60820.1LOC_Os03g60820
LOC_Os09g27900.1LOC_Os09g27900
LOC_Os09g23110.1LOC_Os09g23110
LOC_Os02g17500.1LOC_Os02g17500
LOC_Os02g17500.3LOC_Os02g17500
LOC_Os02g17500.2LOC_Os02g17500
LOC_Os01g04190.3LOC_Os01g04190
LOC_Os01g04190.2LOC_Os01g04190
LOC_Os01g04190.1LOC_Os01g04190
LOC_Os01g04190.4LOC_Os01g04190
LOC_Os04g41460.1LOC_Os04g41460
LOC_Os07g05640.1LOC_Os07g05640
LOC_Os04g43210.1LOC_Os04g43210
LOC_Os04g43210.3LOC_Os04g43210
LOC_Os04g43210.2LOC_Os04g43210
LOC_Os11g40540.2LOC_Os11g40540
LOC_Os11g40540.1LOC_Os11g40540
LOC_Os11g28610.1LOC_Os11g28610
LOC_Os02g58530.1LOC_Os02g58530
LOC_Os02g13560.1LOC_Os02g13560
LOC_Os02g13560.2LOC_Os02g13560
LOC_Os02g13560.4LOC_Os02g13560
LOC_Os02g13560.3LOC_Os02g13560
LOC_Os10g39440.2LOC_Os10g39440
LOC_Os10g39440.1LOC_Os10g39440
LOC_Os10g13440.1LOC_Os10g13440
LOC_Os03g03680.1LOC_Os03g03680
LOC_Os04g44750.1LOC_Os04g44750
LOC_Os04g58230.1LOC_Os04g58230
LOC_Os04g58220.1LOC_Os04g58220
LOC_Os07g39400.1LOC_Os07g39400
LOC_Os03g10100.1LOC_Os03g10100
LOC_Os03g10090.1LOC_Os03g10090
LOC_Os12g32760.1LOC_Os12g32760
LOC_Os12g32940.1LOC_Os12g32940
LOC_Os10g40950.1LOC_Os10g40950
LOC_Os11g41870.1LOC_Os11g41870
LOC_Os11g41850.1LOC_Os11g41850
LOC_Os11g41840.1LOC_Os11g41840
LOC_Os01g73590.1LOC_Os01g73590
LOC_Os07g39350.1LOC_Os07g39350
LOC_Os07g39360.1LOC_Os07g39360
LOC_Os10g21590.2LOC_Os10g21590
LOC_Os10g21590.1LOC_Os10g21590
LOC_Os04g38220.1LOC_Os04g38220
LOC_Os04g37980.1LOC_Os04g37980
LOC_Os04g37970.1LOC_Os04g37970
LOC_Os04g38026.1LOC_Os04g38026
LOC_Os02g36490.3LOC_Os02g36490
LOC_Os02g36490.2LOC_Os02g36490
LOC_Os02g36490.1LOC_Os02g36490
LOC_Os04g38010.1LOC_Os04g38010
LOC_Os04g37990.1LOC_Os04g37990
LOC_Os02g36414.1LOC_Os02g36414
LOC_Os02g36440.1LOC_Os02g36440
LOC_Os02g36450.2LOC_Os02g36450
LOC_Os02g36450.1LOC_Os02g36450
LOC_Os11g38160.1LOC_Os11g38160
LOC_Os05g32900.1LOC_Os05g32900
LOC_Os06g04900.1LOC_Os06g04900
LOC_Os07g03960.1LOC_Os07g03960
LOC_Os07g03910.1LOC_Os07g03910
LOC_Os09g09520.1LOC_Os09g09520
LOC_Os03g01170.1LOC_Os03g01170
LOC_Os10g41190.2LOC_Os10g41190
LOC_Os10g41190.1LOC_Os10g41190
LOC_Os09g24924.1LOC_Os09g24924
LOC_Os09g15330.2LOC_Os09g15330
LOC_Os09g15330.1LOC_Os09g15330
LOC_Os07g10590.1LOC_Os07g10590
LOC_Os03g11900.1LOC_Os03g11900
LOC_Os09g12590.1LOC_Os09g12590
LOC_Os07g37320.1LOC_Os07g37320
LOC_Os07g01560.2LOC_Os07g01560
LOC_Os07g01560.1LOC_Os07g01560
LOC_Os08g08070.1LOC_Os08g08070
LOC_Os02g06540.1LOC_Os02g06540
LOC_Os01g38680.1LOC_Os01g38680
LOC_Os12g04640.1LOC_Os12g04640
LOC_Os01g38670.1LOC_Os01g38670
LOC_Os03g39710.1LOC_Os03g39710
LOC_Os04g31924.2LOC_Os04g31924
LOC_Os06g21930.1LOC_Os06g21930
LOC_Os06g21950.1LOC_Os06g21950
LOC_Os06g21920.1LOC_Os06g21920
LOC_Os01g46860.1LOC_Os01g46860
LOC_Os04g10800.1LOC_Os04g10800
LOC_Os04g10690.1LOC_Os04g10690
LOC_Os04g10750.4LOC_Os04g10750
LOC_Os04g10750.3LOC_Os04g10750
LOC_Os04g10750.2LOC_Os04g10750
LOC_Os04g10750.1LOC_Os04g10750
LOC_Os03g05610.1LOC_Os03g05610
LOC_Os10g30790.2LOC_Os10g30790
LOC_Os10g30790.1LOC_Os10g30790
LOC_Os08g45000.1LOC_Os08g45000
LOC_Os03g04360.1LOC_Os03g04360
LOC_Os03g05640.1LOC_Os03g05640
LOC_Os10g30770.1LOC_Os10g30770
LOC_Os03g05620.1LOC_Os03g05620
LOC_Os02g39750.1LOC_Os02g39750
LOC_Os09g38410.2LOC_Os09g38410
LOC_Os09g38410.1LOC_Os09g38410
LOC_Os11g08370.1LOC_Os11g08370
LOC_Os12g07970.3LOC_Os12g07970
LOC_Os12g07970.2LOC_Os12g07970
LOC_Os12g07970.4LOC_Os12g07970
LOC_Os12g07970.1LOC_Os12g07970
LOC_Os09g39680.1LOC_Os09g39680
LOC_Os01g17240.1LOC_Os01g17240
LOC_Os05g37820.1LOC_Os05g37820
LOC_Os01g63290.2LOC_Os01g63290
LOC_Os01g63290.1LOC_Os01g63290
LOC_Os06g08170.1LOC_Os06g08170
LOC_Os02g43620.1LOC_Os02g43620
LOC_Os08g06010.1LOC_Os08g06010
LOC_Os04g46880.2LOC_Os04g46880
LOC_Os04g46880.1LOC_Os04g46880
LOC_Os09g20520.1LOC_Os09g20520
LOC_Os08g31700.1LOC_Os08g31700
LOC_Os09g20510.1LOC_Os09g20510
LOC_Os09g20500.1LOC_Os09g20500
LOC_Os09g20490.1LOC_Os09g20490
LOC_Os09g20480.1LOC_Os09g20480
LOC_Os08g31670.1LOC_Os08g31670
LOC_Os07g10820.1LOC_Os07g10820
LOC_Os03g59450.1LOC_Os03g59450
LOC_Os01g36720.1LOC_Os01g36720
LOC_Os01g50820.1LOC_Os01g50820
LOC_Os02g02190.1LOC_Os02g02190
LOC_Os02g02170.1LOC_Os02g02170