Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os05g46220.1LOC_Os05g46220
LOC_Os11g43960.1LOC_Os11g43960
LOC_Os05g23720.1LOC_Os05g23720
LOC_Os02g48720.2LOC_Os02g48720
LOC_Os02g48720.1LOC_Os02g48720
LOC_Os05g50840.2LOC_Os05g50840
LOC_Os05g50840.1LOC_Os05g50840
LOC_Os02g10740.1LOC_Os02g10740
LOC_Os06g40200.2LOC_Os06g40200
LOC_Os06g40200.1LOC_Os06g40200
LOC_Os02g13300.2LOC_Os02g13300
LOC_Os02g13300.1LOC_Os02g13300
LOC_Os01g51250.1LOC_Os01g51250
LOC_Os01g38990.1LOC_Os01g38990
LOC_Os03g16080.2LOC_Os03g16080
LOC_Os03g16080.1LOC_Os03g16080
LOC_Os01g04990.2LOC_Os01g04990
LOC_Os01g04990.1LOC_Os01g04990
LOC_Os01g16040.1LOC_Os01g16040
LOC_Os03g09110.1LOC_Os03g09110
LOC_Os01g70800.2LOC_Os01g70800
LOC_Os01g70800.1LOC_Os01g70800
LOC_Os09g32200.1LOC_Os09g32200
LOC_Os08g40850.1LOC_Os08g40850
LOC_Os06g40050.2LOC_Os06g40050
LOC_Os06g40050.1LOC_Os06g40050
LOC_Os05g07900.2LOC_Os05g07900
LOC_Os05g07900.1LOC_Os05g07900
LOC_Os02g10800.1LOC_Os02g10800
LOC_Os02g10800.3LOC_Os02g10800
LOC_Os02g10800.2LOC_Os02g10800
LOC_Os03g52430.1LOC_Os03g52430
LOC_Os05g32630.1LOC_Os05g32630
LOC_Os03g15860.1LOC_Os03g15860
LOC_Os09g33470.3LOC_Os09g33470
LOC_Os09g33470.2LOC_Os09g33470
LOC_Os09g33470.1LOC_Os09g33470
LOC_Os02g13170.1LOC_Os02g13170
LOC_Os05g28870.1LOC_Os05g28870
LOC_Os01g32980.1LOC_Os01g32980
LOC_Os09g27240.2LOC_Os09g27240
LOC_Os09g27240.1LOC_Os09g27240
LOC_Os10g25830.1LOC_Os10g25830
LOC_Os03g07890.1LOC_Os03g07890
LOC_Os03g54760.1LOC_Os03g54760
LOC_Os01g22600.1LOC_Os01g22600
LOC_Os03g18550.2LOC_Os03g18550
LOC_Os03g18550.1LOC_Os03g18550
LOC_Os07g19460.1LOC_Os07g19460
LOC_Os05g29860.3LOC_Os05g29860
LOC_Os05g29860.2LOC_Os05g29860
LOC_Os05g29860.1LOC_Os05g29860
LOC_Os12g01240.1LOC_Os12g01240
LOC_Os11g01270.1LOC_Os11g01270
LOC_Os03g11510.1LOC_Os03g11510
LOC_Os01g73420.1LOC_Os01g73420
LOC_Os02g44570.2LOC_Os02g44570
LOC_Os02g44570.1LOC_Os02g44570
LOC_Os01g12520.1LOC_Os01g12520
LOC_Os11g23170.3LOC_Os11g23170
LOC_Os11g23170.2LOC_Os11g23170
LOC_Os11g23170.1LOC_Os11g23170
LOC_Os10g42299.3LOC_Os10g42299
LOC_Os10g42299.5LOC_Os10g42299
LOC_Os10g42299.4LOC_Os10g42299
LOC_Os10g42299.2LOC_Os10g42299
LOC_Os10g42299.1LOC_Os10g42299
LOC_Os03g18160.1LOC_Os03g18160
LOC_Os12g34870.2LOC_Os12g34870
LOC_Os12g34870.1LOC_Os12g34870
LOC_Os09g29050.1LOC_Os09g29050
LOC_Os08g37370.2LOC_Os08g37370
LOC_Os08g37370.1LOC_Os08g37370
LOC_Os11g24450.1LOC_Os11g24450
LOC_Os05g11780.1LOC_Os05g11780
LOC_Os11g48040.1LOC_Os11g48040
LOC_Os01g74640.2LOC_Os01g74640
LOC_Os01g74640.3LOC_Os01g74640
LOC_Os01g74640.1LOC_Os01g74640
LOC_Os09g38100.1LOC_Os09g38100
LOC_Os03g15690.2LOC_Os03g15690
LOC_Os03g15690.1LOC_Os03g15690
LOC_Os09g28160.1LOC_Os09g28160
LOC_Os04g37600.1LOC_Os04g37600
LOC_Os06g10810.1LOC_Os06g10810
LOC_Os02g52860.1LOC_Os02g52860
LOC_Os01g12470.1LOC_Os01g12470
LOC_Os08g29720.2LOC_Os08g29720
LOC_Os08g29720.1LOC_Os08g29720
LOC_Os04g44540.2LOC_Os04g44540
LOC_Os04g44540.1LOC_Os04g44540