Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os02g49760.2LOC_Os02g49760
LOC_Os02g49760.1LOC_Os02g49760
LOC_Os02g49760.3LOC_Os02g49760
LOC_Os02g49760.4LOC_Os02g49760
LOC_Os06g15910.1LOC_Os06g15910
LOC_Os06g42030.1LOC_Os06g42030
LOC_Os03g21890.1LOC_Os03g21890
LOC_Os07g48130.2LOC_Os07g48130
LOC_Os07g48130.1LOC_Os07g48130
LOC_Os07g48130.3LOC_Os07g48130
LOC_Os07g48130.4LOC_Os07g48130
LOC_Os01g27170.1LOC_Os01g27170
LOC_Os07g47350.2LOC_Os07g47350
LOC_Os07g47350.1LOC_Os07g47350
LOC_Os01g70940.2LOC_Os01g70940
LOC_Os01g70940.1LOC_Os01g70940
LOC_Os01g70940.3LOC_Os01g70940
LOC_Os06g45940.2LOC_Os06g45940
LOC_Os06g45940.1LOC_Os06g45940
LOC_Os01g70490.1LOC_Os01g70490
LOC_Os03g37830.1LOC_Os03g37830
LOC_Os03g37930.1LOC_Os03g37930
LOC_Os03g37840.1LOC_Os03g37840
LOC_Os04g32920.2LOC_Os04g32920
LOC_Os04g32920.1LOC_Os04g32920
LOC_Os04g32920.4LOC_Os04g32920
LOC_Os04g32920.3LOC_Os04g32920
LOC_Os04g32920.5LOC_Os04g32920
LOC_Os02g31940.1LOC_Os02g31940
LOC_Os02g31910.2LOC_Os02g31910
LOC_Os02g31910.1LOC_Os02g31910
LOC_Os09g21000.1LOC_Os09g21000
LOC_Os07g32530.1LOC_Os07g32530
LOC_Os04g52120.1LOC_Os04g52120
LOC_Os09g38960.4LOC_Os09g38960
LOC_Os09g38960.3LOC_Os09g38960
LOC_Os09g38960.2LOC_Os09g38960
LOC_Os08g10550.1LOC_Os08g10550
LOC_Os04g52390.1LOC_Os04g52390
LOC_Os08g39950.1LOC_Os08g39950
LOC_Os01g70660.1LOC_Os01g70660
LOC_Os08g36340.1LOC_Os08g36340
LOC_Os09g27580.2LOC_Os09g27580
LOC_Os09g27580.3LOC_Os09g27580
LOC_Os09g27580.1LOC_Os09g27580