Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os10g17280.1LOC_Os10g17280
LOC_Os12g10570.1LOC_Os12g10570
LOC_Os05g35320.1LOC_Os05g35320
LOC_Os12g19430.1LOC_Os12g19430
LOC_Os03g55874.1LOC_Os03g55874
LOC_Os06g02980.1LOC_Os06g02980
LOC_Os01g58000.1LOC_Os01g58000
LOC_Os05g47980.1LOC_Os05g47980
LOC_Os01g49190.1LOC_Os01g49190
LOC_Os01g40470.1LOC_Os01g40470
LOC_Os03g52660.1LOC_Os03g52660
LOC_Os07g36470.1LOC_Os07g36470
LOC_Os01g42430.1LOC_Os01g42430
LOC_Os01g73130.1LOC_Os01g73130
LOC_Os02g34510.1LOC_Os02g34510
LOC_Os05g01560.2LOC_Os05g01560
LOC_Os05g01560.1LOC_Os05g01560
LOC_Os11g06890.1LOC_Os11g06890
LOC_Os11g06890.2LOC_Os11g06890
LOC_Os04g05080.1LOC_Os04g05080
LOC_Os02g47320.1LOC_Os02g47320
LOC_Os04g51270.2LOC_Os04g51270
LOC_Os04g51270.1LOC_Os04g51270
LOC_Os10g21230.2LOC_Os10g21230
LOC_Os10g21230.1LOC_Os10g21230
LOC_Os01g61780.1LOC_Os01g61780
LOC_Os10g10500.1LOC_Os10g10500
LOC_Os03g14690.1LOC_Os03g14690
LOC_Os05g40230.1LOC_Os05g40230
LOC_Os01g46980.1LOC_Os01g46980
LOC_Os01g12260.1LOC_Os01g12260
LOC_Os03g17070.1LOC_Os03g17070
LOC_Os07g31310.1LOC_Os07g31310
LOC_Os07g31300.1LOC_Os07g31300
LOC_Os04g55040.2LOC_Os04g55040
LOC_Os04g55040.1LOC_Os04g55040
LOC_Os02g51470.1LOC_Os02g51470
LOC_Os02g51470.3LOC_Os02g51470
LOC_Os02g51470.2LOC_Os02g51470
LOC_Os07g32880.1LOC_Os07g32880
LOC_Os02g07870.1LOC_Os02g07870
LOC_Os05g51530.2LOC_Os05g51530
LOC_Os05g51530.1LOC_Os05g51530
LOC_Os08g15170.1LOC_Os08g15170
LOC_Os12g23630.1LOC_Os12g23630
LOC_Os09g08910.1LOC_Os09g08910
LOC_Os01g08350.1LOC_Os01g08350
LOC_Os10g21240.1LOC_Os10g21240
LOC_Os09g08880.1LOC_Os09g08880
LOC_Os04g16740.1LOC_Os04g16740
LOC_Os03g48471.1LOC_Os03g48471
LOC_Os12g23610.1LOC_Os12g23610
LOC_Os01g51380.2LOC_Os01g51380
LOC_Os01g51380.1LOC_Os01g51380