Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os04g55260.1LOC_Os04g55260
LOC_Os03g49940.1LOC_Os03g49940
LOC_Os10g35140.1LOC_Os10g35140
LOC_Os02g47500.1LOC_Os02g47500
LOC_Os06g49500.3LOC_Os06g49500
LOC_Os06g49500.2LOC_Os06g49500
LOC_Os06g49500.1LOC_Os06g49500
LOC_Os09g25810.2LOC_Os09g25810
LOC_Os09g25800.1LOC_Os09g25800
LOC_Os09g25784.2LOC_Os09g25784
LOC_Os09g25784.1LOC_Os09g25784
LOC_Os09g25770.2LOC_Os09g25770
LOC_Os09g25770.1LOC_Os09g25770
LOC_Os01g36580.1LOC_Os01g36580
LOC_Os01g36560.1LOC_Os01g36560
LOC_Os01g36590.1LOC_Os01g36590
LOC_Os07g34340.1LOC_Os07g34340
LOC_Os07g34110.1LOC_Os07g34110
LOC_Os07g34320.1LOC_Os07g34320
LOC_Os07g34070.1LOC_Os07g34070
LOC_Os01g10990.1LOC_Os01g10990
LOC_Os01g10980.1LOC_Os01g10980
LOC_Os01g10970.1LOC_Os01g10970
LOC_Os05g01570.1LOC_Os05g01570
LOC_Os05g01580.1LOC_Os05g01580
LOC_Os11g04140.1LOC_Os11g04140
LOC_Os12g03920.1LOC_Os12g03920
LOC_Os12g33300.1LOC_Os12g33300
LOC_Os04g34490.1LOC_Os04g34490
LOC_Os04g38430.2LOC_Os04g38430
LOC_Os04g38430.1LOC_Os04g38430
LOC_Os06g01840.2LOC_Os06g01840
LOC_Os06g01840.1LOC_Os06g01840
LOC_Os06g01972.1LOC_Os06g01972
LOC_Os06g01966.1LOC_Os06g01966
LOC_Os02g01326.1LOC_Os02g01326
LOC_Os04g59120.1LOC_Os04g59120
LOC_Os04g34530.2LOC_Os04g34530
LOC_Os04g34530.1LOC_Os04g34530
LOC_Os10g12190.1LOC_Os10g12190
LOC_Os10g12400.1LOC_Os10g12400
LOC_Os10g12500.1LOC_Os10g12500
LOC_Os08g31130.1LOC_Os08g31130
LOC_Os05g28930.1LOC_Os05g28930
LOC_Os10g07998.1LOC_Os10g07998
LOC_Os12g18960.2LOC_Os12g18960
LOC_Os12g18960.1LOC_Os12g18960
LOC_Os01g19290.1LOC_Os01g19290
LOC_Os01g19240.1LOC_Os01g19240
LOC_Os10g14920.6LOC_Os10g14920
LOC_Os10g14920.5LOC_Os10g14920
LOC_Os10g14920.7LOC_Os10g14920
LOC_Os10g14920.3LOC_Os10g14920
LOC_Os10g14920.2LOC_Os10g14920
LOC_Os10g14920.1LOC_Os10g14920
LOC_Os10g09710.1LOC_Os10g09710
LOC_Os02g52930.1LOC_Os02g52930
LOC_Os05g33900.1LOC_Os05g33900
LOC_Os05g41420.1LOC_Os05g41420
LOC_Os01g58910.1LOC_Os01g58910
LOC_Os03g05530.1LOC_Os03g05530
LOC_Os08g44750.1LOC_Os08g44750
LOC_Os02g02310.1LOC_Os02g02310
LOC_Os02g22680.1LOC_Os02g22680
LOC_Os01g02870.1LOC_Os01g02870
LOC_Os06g01660.1LOC_Os06g01660
LOC_Os11g37720.1LOC_Os11g37720
LOC_Os07g30210.2LOC_Os07g30210
LOC_Os07g30210.1LOC_Os07g30210
LOC_Os03g58620.1LOC_Os03g58620
LOC_Os09g29239.2LOC_Os09g29239
LOC_Os09g29239.3LOC_Os09g29239
LOC_Os09g29239.1LOC_Os09g29239
LOC_Os09g29210.2LOC_Os09g29210
LOC_Os09g29210.1LOC_Os09g29210
LOC_Os03g08880.1LOC_Os03g08880
LOC_Os01g31940.1LOC_Os01g31940
LOC_Os05g48300.1LOC_Os05g48300
LOC_Os01g48800.1LOC_Os01g48800
LOC_Os09g38510.1LOC_Os09g38510
LOC_Os04g49748.1LOC_Os04g49748
LOC_Os09g37640.1LOC_Os09g37640
LOC_Os04g49757.2LOC_Os04g49757
LOC_Os04g49757.1LOC_Os04g49757
LOC_Os04g49739.1LOC_Os04g49739
LOC_Os02g46380.2LOC_Os02g46380
LOC_Os02g46380.3LOC_Os02g46380
LOC_Os02g46380.1LOC_Os02g46380
LOC_Os12g31860.1LOC_Os12g31860
LOC_Os12g31860.3LOC_Os12g31860
LOC_Os12g31860.2LOC_Os12g31860
LOC_Os12g31860.4LOC_Os12g31860
LOC_Os12g31860.5LOC_Os12g31860
LOC_Os12g31860.6LOC_Os12g31860
LOC_Os12g31890.1LOC_Os12g31890
LOC_Os12g31850.3LOC_Os12g31850
LOC_Os12g31850.4LOC_Os12g31850
LOC_Os12g31850.2LOC_Os12g31850
LOC_Os12g31850.1LOC_Os12g31850
LOC_Os04g41320.1LOC_Os04g41320
LOC_Os02g39200.1LOC_Os02g39200
LOC_Os01g67330.2LOC_Os01g67330
LOC_Os01g67330.1LOC_Os01g67330
LOC_Os06g33210.1LOC_Os06g33210
LOC_Os07g38610.1LOC_Os07g38610
LOC_Os02g36390.4LOC_Os02g36390
LOC_Os02g36390.1LOC_Os02g36390
LOC_Os02g36390.3LOC_Os02g36390
LOC_Os02g36390.2LOC_Os02g36390
LOC_Os06g19380.1LOC_Os06g19380
LOC_Os02g49260.1LOC_Os02g49260
LOC_Os07g39280.1LOC_Os07g39280
LOC_Os12g05830.1LOC_Os12g05830
LOC_Os12g05780.3LOC_Os12g05780
LOC_Os12g05780.2LOC_Os12g05780
LOC_Os05g12490.1LOC_Os05g12490
LOC_Os02g40090.5LOC_Os02g40090
LOC_Os02g40090.4LOC_Os02g40090
LOC_Os02g40090.3LOC_Os02g40090
LOC_Os02g40090.1LOC_Os02g40090
LOC_Os10g33920.3LOC_Os10g33920
LOC_Os10g33920.2LOC_Os10g33920
LOC_Os10g33920.1LOC_Os10g33920
LOC_Os02g41780.1LOC_Os02g41780
LOC_Os06g30950.2LOC_Os06g30950
LOC_Os06g30950.1LOC_Os06g30950
LOC_Os05g07670.1LOC_Os05g07670
LOC_Os01g07310.4LOC_Os01g07310
LOC_Os01g60780.2LOC_Os01g60780
LOC_Os01g60780.1LOC_Os01g60780
LOC_Os01g07310.1LOC_Os01g07310
LOC_Os01g07310.3LOC_Os01g07310
LOC_Os01g07310.2LOC_Os01g07310
LOC_Os03g49570.1LOC_Os03g49570
LOC_Os08g04110.2LOC_Os08g04110
LOC_Os08g04110.1LOC_Os08g04110
LOC_Os01g58870.1LOC_Os01g58870
LOC_Os05g41480.2LOC_Os05g41480
LOC_Os05g41480.1LOC_Os05g41480
LOC_Os12g04170.1LOC_Os12g04170
LOC_Os10g34490.1LOC_Os10g34490
LOC_Os11g04380.1LOC_Os11g04380
LOC_Os01g54580.1LOC_Os01g54580
LOC_Os06g05980.2LOC_Os06g05980
LOC_Os06g05980.1LOC_Os06g05980
LOC_Os08g01410.1LOC_Os08g01410
LOC_Os04g59550.5LOC_Os04g59550
LOC_Os04g59550.2LOC_Os04g59550
LOC_Os04g59550.1LOC_Os04g59550
LOC_Os04g59550.4LOC_Os04g59550
LOC_Os04g59550.3LOC_Os04g59550
LOC_Os03g17740.1LOC_Os03g17740
LOC_Os05g03070.2LOC_Os05g03070
LOC_Os05g03070.1LOC_Os05g03070
LOC_Os08g08840.2LOC_Os08g08840
LOC_Os08g08840.1LOC_Os08g08840
LOC_Os07g33910.2LOC_Os07g33910
LOC_Os07g34006.1LOC_Os07g34006
LOC_Os07g33954.1LOC_Os07g33954
LOC_Os05g15160.1LOC_Os05g15160
LOC_Os01g13770.3LOC_Os01g13770
LOC_Os01g13770.2LOC_Os01g13770
LOC_Os01g13770.1LOC_Os01g13770
LOC_Os09g12600.2LOC_Os09g12600
LOC_Os09g12600.1LOC_Os09g12600
LOC_Os08g25624.4LOC_Os08g25624
LOC_Os08g25624.2LOC_Os08g25624
LOC_Os08g25624.1LOC_Os08g25624
LOC_Os08g25624.3LOC_Os08g25624
LOC_Os05g07870.1LOC_Os05g07870
LOC_Os01g07730.1LOC_Os01g07730
LOC_Os02g40030.2LOC_Os02g40030
LOC_Os02g40030.1LOC_Os02g40030
LOC_Os03g61100.1LOC_Os03g61100
LOC_Os08g01610.2LOC_Os08g01610
LOC_Os08g01610.1LOC_Os08g01610
LOC_Os08g01610.3LOC_Os08g01610
LOC_Os09g14520.1LOC_Os09g14520
LOC_Os08g10350.1LOC_Os08g10350
LOC_Os03g11590.1LOC_Os03g11590
LOC_Os03g11590.5LOC_Os03g11590
LOC_Os03g11590.4LOC_Os03g11590
LOC_Os03g11590.3LOC_Os03g11590
LOC_Os03g11590.2LOC_Os03g11590
LOC_Os02g06010.2LOC_Os02g06010
LOC_Os02g06010.1LOC_Os02g06010
LOC_Os03g18990.1LOC_Os03g18990
LOC_Os05g02490.1LOC_Os05g02490
LOC_Os03g02670.3LOC_Os03g02670
LOC_Os03g02670.1LOC_Os03g02670
LOC_Os03g02670.2LOC_Os03g02670