Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os04g51310.1LOC_Os04g51310
LOC_Os06g38950.1LOC_Os06g38950
LOC_Os08g30780.1LOC_Os08g30780
LOC_Os09g19680.1LOC_Os09g19680
LOC_Os08g30770.1LOC_Os08g30770
LOC_Os02g11960.1LOC_Os02g11960
LOC_Os02g01820.1LOC_Os02g01820
LOC_Os03g20170.1LOC_Os03g20170
LOC_Os02g56550.1LOC_Os02g56550
LOC_Os12g34010.1LOC_Os12g34010
LOC_Os01g56400.1LOC_Os01g56400
LOC_Os05g33230.1LOC_Os05g33230
LOC_Os01g50070.1LOC_Os01g50070
LOC_Os12g13720.2LOC_Os12g13720
LOC_Os12g13720.1LOC_Os12g13720
LOC_Os02g32690.2LOC_Os02g32690
LOC_Os02g32690.1LOC_Os02g32690
LOC_Os01g52560.1LOC_Os01g52560
LOC_Os06g36090.2LOC_Os06g36090
LOC_Os06g36090.1LOC_Os06g36090
LOC_Os10g13830.1LOC_Os10g13830
LOC_Os08g43120.1LOC_Os08g43120
LOC_Os07g33780.1LOC_Os07g33780
LOC_Os11g37700.1LOC_Os11g37700
LOC_Os02g21340.1LOC_Os02g21340
LOC_Os02g11760.1LOC_Os02g11760
LOC_Os08g29570.1LOC_Os08g29570
LOC_Os01g42410.1LOC_Os01g42410
LOC_Os09g16290.1LOC_Os09g16290
LOC_Os09g16380.1LOC_Os09g16380
LOC_Os09g16449.3LOC_Os09g16449
LOC_Os09g16449.1LOC_Os09g16449
LOC_Os09g16449.2LOC_Os09g16449
LOC_Os09g16330.2LOC_Os09g16330
LOC_Os09g16330.1LOC_Os09g16330
LOC_Os01g42380.1LOC_Os01g42380
LOC_Os01g42370.1LOC_Os01g42370
LOC_Os01g42350.1LOC_Os01g42350
LOC_Os01g08260.2LOC_Os01g08260
LOC_Os01g08260.1LOC_Os01g08260
LOC_Os12g32820.2LOC_Os12g32820
LOC_Os05g04600.1LOC_Os05g04600
LOC_Os12g32820.1LOC_Os12g32820
LOC_Os09g29670.1LOC_Os09g29670
LOC_Os09g29660.1LOC_Os09g29660
LOC_Os07g18874.1LOC_Os07g18874
LOC_Os12g22284.1LOC_Os12g22284
LOC_Os12g22110.1LOC_Os12g22110
LOC_Os09g03939.2LOC_Os09g03939
LOC_Os09g03939.1LOC_Os09g03939
LOC_Os09g07670.1LOC_Os09g07670
LOC_Os10g08014.1LOC_Os10g08014
LOC_Os05g13520.1LOC_Os05g13520
LOC_Os10g35180.1LOC_Os10g35180
LOC_Os04g44610.1LOC_Os04g44610
LOC_Os03g64200.2LOC_Os03g64200
LOC_Os03g64200.1LOC_Os03g64200
LOC_Os01g03144.1LOC_Os01g03144
LOC_Os11g07600.1LOC_Os11g07600
LOC_Os08g07010.1LOC_Os08g07010
LOC_Os06g40550.1LOC_Os06g40550
LOC_Os03g06139.1LOC_Os03g06139
LOC_Os10g30610.2LOC_Os10g30610
LOC_Os10g30610.1LOC_Os10g30610
LOC_Os04g11820.1LOC_Os04g11820
LOC_Os11g22350.1LOC_Os11g22350
LOC_Os06g51460.2LOC_Os06g51460
LOC_Os06g51460.1LOC_Os06g51460
LOC_Os07g04660.1LOC_Os07g04660
LOC_Os05g02870.1LOC_Os05g02870
LOC_Os05g02890.1LOC_Os05g02890
LOC_Os03g17370.1LOC_Os03g17370
LOC_Os01g61940.1LOC_Os01g61940
LOC_Os03g17350.1LOC_Os03g17350
LOC_Os09g23640.1LOC_Os09g23640
LOC_Os05g31910.2LOC_Os05g31910
LOC_Os05g31910.1LOC_Os05g31910
LOC_Os06g30730.1LOC_Os06g30730
LOC_Os01g42900.1LOC_Os01g42900
LOC_Os05g02750.1LOC_Os05g02750
LOC_Os09g16458.1LOC_Os09g16458
LOC_Os06g24460.1LOC_Os06g24460
LOC_Os08g30740.1LOC_Os08g30740
LOC_Os03g21490.2LOC_Os03g21490
LOC_Os03g21490.1LOC_Os03g21490
LOC_Os03g54790.1LOC_Os03g54790
LOC_Os07g28090.1LOC_Os07g28090
LOC_Os01g68330.1LOC_Os01g68330
LOC_Os06g48060.1LOC_Os06g48060
LOC_Os11g29850.2LOC_Os11g29850
LOC_Os11g29850.1LOC_Os11g29850
LOC_Os03g46740.2LOC_Os03g46740
LOC_Os03g46740.1LOC_Os03g46740
LOC_Os04g53550.1LOC_Os04g53550
LOC_Os11g39020.1LOC_Os11g39020
LOC_Os06g03770.1LOC_Os06g03770
LOC_Os01g74280.1LOC_Os01g74280
LOC_Os06g08560.1LOC_Os06g08560
LOC_Os04g52900.2LOC_Os04g52900
LOC_Os04g52900.1LOC_Os04g52900
LOC_Os01g25386.1LOC_Os01g25386
LOC_Os04g13220.1LOC_Os04g13220
LOC_Os04g13210.1LOC_Os04g13210
LOC_Os12g37580.1LOC_Os12g37580
LOC_Os11g05700.1LOC_Os11g05700
LOC_Os06g06440.1LOC_Os06g06440
LOC_Os06g36650.1LOC_Os06g36650
LOC_Os05g10730.2LOC_Os05g10730
LOC_Os05g10730.3LOC_Os05g10730
LOC_Os05g10730.1LOC_Os05g10730
LOC_Os03g04920.1LOC_Os03g04920
LOC_Os01g67580.1LOC_Os01g67580
LOC_Os04g49900.1LOC_Os04g49900
LOC_Os04g49890.1LOC_Os04g49890
LOC_Os01g07870.1LOC_Os01g07870
LOC_Os02g18700.1LOC_Os02g18700
LOC_Os02g18670.1LOC_Os02g18670
LOC_Os08g05710.1LOC_Os08g05710
LOC_Os08g05690.1LOC_Os08g05690
LOC_Os04g40570.1LOC_Os04g40570
LOC_Os02g09720.1LOC_Os02g09720
LOC_Os01g52550.1LOC_Os01g52550
LOC_Os05g04610.1LOC_Os05g04610
LOC_Os01g18670.1LOC_Os01g18670
LOC_Os01g50080.1LOC_Os01g50080
LOC_Os01g50100.1LOC_Os01g50100
LOC_Os01g50160.1LOC_Os01g50160
LOC_Os05g47500.1LOC_Os05g47500
LOC_Os01g35030.1LOC_Os01g35030
LOC_Os01g34970.2LOC_Os01g34970
LOC_Os01g34970.1LOC_Os01g34970
LOC_Os05g47490.1LOC_Os05g47490
LOC_Os02g21750.1LOC_Os02g21750
LOC_Os03g08380.1LOC_Os03g08380
LOC_Os03g17180.1LOC_Os03g17180
LOC_Os01g74470.1LOC_Os01g74470
LOC_Os08g45030.1LOC_Os08g45030
LOC_Os01g29870.1LOC_Os01g29870
LOC_Os04g54930.1LOC_Os04g54930
LOC_Os04g38570.2LOC_Os04g38570
LOC_Os04g38570.1LOC_Os04g38570
LOC_Os02g46680.1LOC_Os02g46680
LOC_Os01g03650.1LOC_Os01g03650
LOC_Os04g33700.1LOC_Os04g33700
LOC_Os01g61400.1LOC_Os01g61400
LOC_Os05g01700.1LOC_Os05g01700
LOC_Os01g73530.2LOC_Os01g73530
LOC_Os01g73530.1LOC_Os01g73530
LOC_Os01g11946.2LOC_Os01g11946
LOC_Os01g11946.1LOC_Os01g11946
LOC_Os04g46700.2LOC_Os04g46700
LOC_Os04g46700.1LOC_Os04g46700