Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice Transporter Database
   Transporter Families  AAA  AAAP  ABC  AE  AEC  APC  Amt  Annexin  ArAE  ArsAB  ArsB  BASS  CCC  CDF  CEPT  CPA1  CPA2  CaCA  ClC  Ctr  DASS  DMT  ENT  F-ATPase  FBT  FP  GIC  GPH  GUP  H+-PPase  HAAAP  IISP  KUP  LCT  MC  MEX  MFS  MIP  MIT  MOP  MPT  MscS  NCS1  NCS2  NSCC2  NhaD  NiCoT  Nramp  OPT  Oxa1  P-ATPase  POT  PPI  PiT  RND  SSS  SulP  TDT  Tat  Tic110  Trk  VIC  ZIP   
  Sequence Information  MSU/TIGR V7 Model MSU/TIGR V7 Locus TC Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU/TIGR V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os11g09020.1LOC_Os11g09020
LOC_Os12g09320.1LOC_Os12g09320
LOC_Os12g08130.1LOC_Os12g08130
LOC_Os12g08090.1LOC_Os12g08090
LOC_Os02g46810.1LOC_Os02g46810
LOC_Os01g43040.1LOC_Os01g43040
LOC_Os08g32070.1LOC_Os08g32070
LOC_Os04g41350.1LOC_Os04g41350
LOC_Os05g34980.1LOC_Os05g34980
LOC_Os01g66010.1LOC_Os01g66010
LOC_Os02g01210.1LOC_Os02g01210
LOC_Os07g04180.2LOC_Os07g04180
LOC_Os07g04180.1LOC_Os07g04180
LOC_Os06g36180.1LOC_Os06g36180
LOC_Os06g12330.1LOC_Os06g12330
LOC_Os01g65670.1LOC_Os01g65670
LOC_Os06g12350.1LOC_Os06g12350
LOC_Os12g09300.2LOC_Os12g09300
LOC_Os12g09300.1LOC_Os12g09300
LOC_Os01g65660.2LOC_Os01g65660
LOC_Os01g65660.1LOC_Os01g65660
LOC_Os04g56470.2LOC_Os04g56470
LOC_Os04g56470.1LOC_Os04g56470
LOC_Os04g39489.2LOC_Os04g39489
LOC_Os04g39489.1LOC_Os04g39489
LOC_Os02g49060.1LOC_Os02g49060
LOC_Os02g49510.1LOC_Os02g49510
LOC_Os06g16420.3LOC_Os06g16420
LOC_Os06g16420.2LOC_Os06g16420
LOC_Os06g16420.1LOC_Os06g16420
LOC_Os02g09810.3LOC_Os02g09810
LOC_Os02g09810.2LOC_Os02g09810
LOC_Os02g09810.1LOC_Os02g09810
LOC_Os01g61044.2LOC_Os01g61044
LOC_Os01g61044.1LOC_Os01g61044
LOC_Os12g09300.3LOC_Os12g09300
LOC_Os11g06820.1LOC_Os11g06820
LOC_Os10g05690.1LOC_Os10g05690
LOC_Os03g14080.1LOC_Os03g14080
LOC_Os05g37470.3LOC_Os05g37470
LOC_Os05g37470.1LOC_Os05g37470
LOC_Os05g37470.2LOC_Os05g37470
LOC_Os01g63770.2LOC_Os01g63770
LOC_Os01g63770.1LOC_Os01g63770
LOC_Os07g12770.1LOC_Os07g12770
LOC_Os03g60260.1LOC_Os03g60260
LOC_Os04g47780.1LOC_Os04g47780
LOC_Os02g44980.1LOC_Os02g44980
LOC_Os11g19240.1LOC_Os11g19240
LOC_Os06g12320.1LOC_Os06g12320
LOC_Os04g38670.1LOC_Os04g38670
LOC_Os01g41420.1LOC_Os01g41420
LOC_Os05g30150.1LOC_Os05g30150
LOC_Os01g40410.1LOC_Os01g40410
LOC_Os01g41400.1LOC_Os01g41400
LOC_Os01g40380.1LOC_Os01g40380
LOC_Os04g38680.1LOC_Os04g38680
LOC_Os04g38660.1LOC_Os04g38660
LOC_Os02g54730.1LOC_Os02g54730
LOC_Os12g38570.1LOC_Os12g38570
LOC_Os04g12499.1LOC_Os04g12499
LOC_Os02g01100.1LOC_Os02g01100
LOC_Os02g01100.2LOC_Os02g01100
LOC_Os02g01100.3LOC_Os02g01100
LOC_Os01g40390.1LOC_Os01g40390
LOC_Os12g30040.1LOC_Os12g30040
LOC_Os04g47420.1LOC_Os04g47420
LOC_Os05g14820.1LOC_Os05g14820
LOC_Os12g14100.1LOC_Os12g14100
LOC_Os08g03350.1LOC_Os08g03350
LOC_Os04g38860.2LOC_Os04g38860
LOC_Os04g38860.1LOC_Os04g38860
LOC_Os10g27980.1LOC_Os10g27980
LOC_Os01g63854.1LOC_Os01g63854
LOC_Os05g50920.1LOC_Os05g50920
LOC_Os01g43320.1LOC_Os01g43320
LOC_Os03g44230.1LOC_Os03g44230
LOC_Os07g01090.2LOC_Os07g01090
LOC_Os07g01090.1LOC_Os07g01090
LOC_Os01g68050.2LOC_Os01g68050
LOC_Os01g68050.1LOC_Os01g68050