LOC_Os04g32620.1

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Digital Northern Data
MPSS mRNA Data
MPSS smallRNA Data
Sequence Information Orthologs in Plants
MSU V7 Model: LOC_Os04g32620.1 Brachypodium distachyon: Bradi5g08380.1
MSU V7 Locus: LOC_Os04g32620 Panicum virgatum: 13228.m00006
Family: AP2-EREBP Sorghum bicolor:
Chromosome: Chr4 Zea mays: GRMZM2G087059_P01;GRMZM2G425798_P01
5' End: 19656024 Arabidopsis thaliana: AT5G13330.1
3' End: 19651659 Cucumis sativus: Cucsa.349200.1
Alternative Splice Products: Glycine max: Glyma04g37870.1;Glyma04g37890.1;Glyma06g17180.1
Putative Function: ethylene-responsive transcription factor ERF114, putative, expressed Medicago truncatula: Medtr3g151340.1;Medtr7g020790.1;Medtr7g020810.1
RAP2 Locus: Os04g0398000 Mimulus guttatus:
RAP3 Locus: Os04g0398000 Populus trichocarpa: POPTR_0001s12990.1;POPTR_0003s16090.1
Ricinus communis: 30128.m008556;30131.m006971;30147.m014403
Vitis vinifera: GSVIVP00006201001
Sequence Quality Mutant Information
TE-related: NIAS Tos17 FST:
EST/cDNA: fl_cDNA NIAS Tos17 KO Line:
PASA Status: PASA_validated OTL Tos17 FST:
Topology OTL Tos17 KO Line:
Transmembrane Domain (TM): 0 UCD Ds FST: FI855006;FI131572;FI131535;FI131489;FI131684;ET190539;ET190531;ET190489;ET190468;ET190401;ET190372;ET190313;ET190186;ET190152;ET190083;ET190019;ET189899;ET189828;ET025656;ET025642;ET025626;ET025606;ET025503;ET025492;ET025406;ET025403;ET025159;ET025154;ET025107;ER936625;ER936391;EI184176;EI027296;EI027214;EI027190;EI027144;EI027093;EI026876;EI026856;EI026796;EI026758;EI026706;EI026658;EI026631;EI026604;EI026593;EI026582;EI026524;ED990329;ED990323;ED990313;ED990290;ED990228;ED990213;ED990189;ED990051;ED989979;ED989946;ED989935;ED989857;ED989836;ED989660;ED989636;ED989624;ED989618;ED989614;ED989610;ED989604;ED989602;ED989601;ED989581;ED989569;ED989566;ED989553;ED989550;ED989547;ED989539;ED989533;ED989522;ED989519;ED989512;ED989509;ED989489;ED989487;ED989486;ED989481;ED989476;ED989475;ED989466;ED551716;ED551990;ED551722;ED482013;ED482004;ED481878;ED481975;ED481931;ED481920;ED481865;ED481842;ED481739;DX888427;DX888362;DX888361;DX888225;DX888210;DX888175;DX888114;DX887968;DX887960;DX887910;DX887799;DX576156;DX576051;DX576010;DU169031;DU168963;DU168878;DU168708;DU168697;DU168693;DU168462;DU168400;DU168392;DU168302;DU168254;CZ444242;CZ167945
N-terminal Signal Peptide (SignalP): UCD Ds KO Line: RdSpm1038_3.1;RdSpm1041A_3.1;RdSpm1043_3.1;RdSpm1078_3.1;RdSpm1087_3.1;RdSpm1089B_3.1;RdSpm1099_3.1;RdSpm1101A_3.1;RdSpm1137_3.1;RdSpm1150_3.1;RdSpm1164B_3.1;RdSpm1396B_3.1;RdSpm1397A_3.1;RdSpm1397B_3.1;RdSpm1397_3.1;RdSpm1398A_3.1;RdSpm1401B_3.1;RdSpm1403_3.1;RdSpm1404_3.1;RdSpm1440A_3.1;RdSpm1483B_3.1;RdSpm1975_3.1;RdSpm2006B_3.1;RdSpm2009_3.1;RdSpm2010A_3.1;RdSpm2010B_3.1;RdSpm2010_3.1;RdSpm2014A_3.1;RdSpm2015A_3.1;RdSpm2015_3.1;RdSpm2016B_3.1;RdSpm2016_3.1;RdSpm2017B_3.1;RdSpm2018A_3.1;RdSpm2018_3.1;RdSpm2020A_3.1;RdSpm2020B_3.1;RdSpm2020_3.1;RdSpm2022A_3.1;RdSpm2022B_3.1;RdSpm2022_3.1;RdSpm2024B_3.1;RdSpm2027A_3.1;RdSpm2027B_3.1;RdSpm2027_3.1;RdSpm2029A_3.1;RdSpm2029B_3.1;RdSpm2029_3.1;RdSpm2030A_3.1;RdSpm2031A_3.1;RdSpm2031_3.1;RdSpm2032_3.1;RdSpm2039_3.1;RdSpm2043B_3.1;RdSpm2043_3.1;RdSpm2048A_3.1;RdSpm2048_3.1;RdSpm2049_3.1;RdSpm2050A_3.1;RdSpm2051_3.1;RdSpm2054A_3.1;RdSpm2054_3.1;RdSpm2058_3.1;RdSpm2131A_3.1;RdSpm2251_3.1;RdSpm2252B_3.1;RdSpm2252C_3.1;RdSpm2252_3.1;RdSpm2253B_3.1;RdSpm2253C_3.1;RdSpm2253_3.1;RdSpm2254A_3.1;RdSpm2254B_3.1;RdSpm2256A_3.1;RdSpm2260A_3.1;RdSpm2609B_3.1;RdSpm2614D_3.1;RdSpm2641B_3.1;RdSpm2689A_3.1;RdSpm2689C_3.1;RdSpm3011_3.1;RdSpm311A_3.1;RdSpm3128B_3.1;RdSpm3210A_3.1;RdSpm3442A_3.1;RdSpm3442_3.1;RdSpm3443A_3.1;RdSpm3445B_3.1;RdSpm3449B_3.1;RdSpm3449_3.1;RdSpm3450B_3.1;RdSpm3450_3.1;RdSpm3511C_3.1;RdSpm3517A_3.1;RdSpm3517_3.1;RdSpm411C_3.1;RdSpm4299_3.1;RdSpm4302D_3.1;RdSpm4318_3.1;RdSpm4326B_3.1;RdSpm4327C_3.1;RdSpm4328_3.1;RdSpm4457A_3.1;RdSpm4457B_3.1;RdSpm4457C_3.1;RdSpm4457_3.1;RdSpm4464A_3.1;RdSpm4464B_3.1;RdSpm4464D_3.1;RdSpm4513A_3.1;RdSpm4513D_3.1;RdSpm4519_3.1;RdSpm4564C_3.1;RdSpm548_3.1;RdSpm571_3.1;RdSpm572A_3.1;RdSpm6068C_3.1;RdSpm656A_3.1;RdSpm686B_3.1;RdSpm693B_3.1;RdSpm694A_3.1;RdSpm694B_3.1;RdSpm697_3.2;RdSpm732_3.1;RdSpm754_3.1;RdSpm757A_3.1;RdSpm757_3.1;RdSpm758B_3.1
Chloroplast Transit Peptide (ChloroP): ChloroP OTL T-DNA FST: CL517623
Predicted Subcellular Localization: Mitochondrion OTL T-DNA KO Line: ABAG10
RMD T-DNA FST:
RMD T-DNA KO Line:
TRIM T-DNA FST: EI010222;CZ556224;CZ554800;CZ552494
TRIM T-DNA KO Line: M0002938;M0025710;M0030223;M0066134
Postech T-DNA FST: A38278;A33977;A17635;C10853;D00485;D00463;D00486;D00484
Postech T-DNA KO Line: 2C-30002;2D-00353;2D-00368;3A-09195;4A-01211;4A-50713