Home General information Database search Download Tree viewer Distribution map Links Contact us  
Rice GT Database
   GT Families  GT1  GT2  GT4  GT5  GT8  GT10  GT13  GT14  GT16  GT17  GT19  GT20  GT21  GT22  GT24  GT28  GT29  GT30  GT31  GT32  GT33  GT34  GT35  GT37  GT41  GT43  GT47  GT48  GT50  GT57  GT58  GT59  GT61  GT64  GT65  GT66  GT68  GT75  GT76  GT77  GT90  Unknown   
  Sequence Information  MSU V7 Model MSU V7 Locus Family Chromosome 5' End 3' End Alternative Splice Products MSU V7 Annotation RAP2 Locus RAP3 Locus NCBI Blast Check/Uncheck All
  Sequence Quality   TE-related EST/cDNA PASA Status Check/Uncheck All
  Orthologs in Plants  Brachypodium distachyon Panicum virgatum Sorghum bicolor Zea mays Arabidopsis thaliana Cucumis sativus Glycine max Medicago truncatula Mimulus guttatus Populus trichocarpa Ricinus communis Vitis vinifera Check/Uncheck All
  Topology  Transmembrane Domain (TM) N-terminal Signal Peptide (SignalP) Chloroplast Transit Peptide (ChloroP) Predicted Subcellular Localization Arabidopsis Golgi Orthologs Check/Uncheck All
  Mutants  NIAS Tos17 FST NIAS Tos17 KO Line OTL Tos17 FST OTL Tos17 KO Line UCD Ds FST UCD Ds KO Line OTL T-DNA FST OTL T-DNA KO Line RMD T-DNA FST RMD T-DNA KO Line TRIM T-DNA FST TRIM T-DNA KO Line Postech T-DNA FST Postech T-DNA KO Line Postech T-DNA AC Line Check/Uncheck All
  Digital Northern Data   Total ESTs Anther Callus Endosperm Flower Immature seed Leaf Mixed Panicle Phloem Pistil Root Root tip Seed Seedling Sheath Shoot Stem Suspension cells Unknown Whole plant Check/Uncheck All
  MPSS mRNA Data   NYR NRA NRB NGD NST NYL NLA NLB NLC NLD NME NPO NOS NIP NGS NCA NSR NSL NDR NDL NCR NCL XC00 XC06 XC24 XR03 XR06 XR12 XR24 XR48 XS03 XS06 XS12 XS24 XS48 MR03 MR06 MR12 MR24 MR48 MS03 MS06 MS12 MS24 MS48 MS96 MC00 MC24 I9RO I9RR I9LA I9LB I9LC I9LD I9ME FRO FRR FLA FLB FLC FLD FME PSC PSI PSL PSN PSY PLA PLW PLC Check/Uncheck All
  MPSS Small RNA Data   STM SNU FLR SNM ABA UNT Check/Uncheck All
  Microarray Data   Show Average Heatmap
 Select Heatmap Scale Bar for Single Channel Array: 7,13
 Select Heatmap Scale Bar for Two Channel Array: -1,1 -2,2 -3,3
 Affymetrix 
 Agilent 22K 
 BGI/Yale 
 NSF 20K 
 NSF 45K 
   
MSU V7 Model MSU V7 Locus
LOC_Os10g24090.1LOC_Os10g24090
LOC_Os06g16000.1LOC_Os06g16000
LOC_Os09g16090.1LOC_Os09g16090
LOC_Os09g16030.1LOC_Os09g16030
LOC_Os04g24110.1LOC_Os04g24110
LOC_Os09g21170.1LOC_Os09g21170
LOC_Os09g21160.1LOC_Os09g21160
LOC_Os04g20260.1LOC_Os04g20260
LOC_Os04g42690.1LOC_Os04g42690
LOC_Os04g20330.1LOC_Os04g20330
LOC_Os04g20400.2LOC_Os04g20400
LOC_Os04g20400.1LOC_Os04g20400
LOC_Os04g20474.4LOC_Os04g20474
LOC_Os04g20474.3LOC_Os04g20474
LOC_Os04g20474.2LOC_Os04g20474
LOC_Os04g20474.1LOC_Os04g20474
LOC_Os04g20540.1LOC_Os04g20540
LOC_Os11g27370.1LOC_Os11g27370
LOC_Os11g26950.1LOC_Os11g26950
LOC_Os01g64540.1LOC_Os01g64540
LOC_Os07g10240.1LOC_Os07g10240
LOC_Os07g10160.1LOC_Os07g10160
LOC_Os07g10190.1LOC_Os07g10190
LOC_Os07g10230.1LOC_Os07g10230
LOC_Os03g59030.1LOC_Os03g59030
LOC_Os02g56010.1LOC_Os02g56010
LOC_Os02g37690.1LOC_Os02g37690
LOC_Os03g49550.1LOC_Os03g49550
LOC_Os12g37510.1LOC_Os12g37510
LOC_Os10g03320.1LOC_Os10g03320
LOC_Os06g11270.1LOC_Os06g11270
LOC_Os03g49524.1LOC_Os03g49524
LOC_Os07g47550.1LOC_Os07g47550
LOC_Os08g15330.1LOC_Os08g15330
LOC_Os06g09240.1LOC_Os06g09240
LOC_Os07g05420.1LOC_Os07g05420
LOC_Os09g03140.1LOC_Os09g03140
LOC_Os07g14630.1LOC_Os07g14630
LOC_Os07g30610.1LOC_Os07g30610
LOC_Os07g30760.1LOC_Os07g30760
LOC_Os07g30690.1LOC_Os07g30690
LOC_Os07g30330.1LOC_Os07g30330
LOC_Os07g30620.1LOC_Os07g30620
LOC_Os07g30469.1LOC_Os07g30469
LOC_Os07g30369.1LOC_Os07g30369
LOC_Os11g25454.1LOC_Os11g25454
LOC_Os07g13940.1LOC_Os07g13940
LOC_Os07g13810.1LOC_Os07g13810
LOC_Os07g13660.1LOC_Os07g13660
LOC_Os03g60960.1LOC_Os03g60960
LOC_Os07g13800.1LOC_Os07g13800
LOC_Os07g13770.1LOC_Os07g13770
LOC_Os07g13634.1LOC_Os07g13634
LOC_Os07g42970.1LOC_Os07g42970
LOC_Os02g51930.1LOC_Os02g51930
LOC_Os08g31200.1LOC_Os08g31200
LOC_Os04g25490.1LOC_Os04g25490
LOC_Os04g25440.2LOC_Os04g25440
LOC_Os04g25440.1LOC_Os04g25440
LOC_Os04g25800.1LOC_Os04g25800
LOC_Os04g24850.1LOC_Os04g24850
LOC_Os04g25980.1LOC_Os04g25980
LOC_Os04g25370.1LOC_Os04g25370
LOC_Os04g25970.1LOC_Os04g25970
LOC_Os04g25380.1LOC_Os04g25380
LOC_Os04g37820.1LOC_Os04g37820
LOC_Os02g36810.1LOC_Os02g36810
LOC_Os02g36840.1LOC_Os02g36840
LOC_Os02g36830.1LOC_Os02g36830
LOC_Os02g28900.1LOC_Os02g28900
LOC_Os02g51910.1LOC_Os02g51910
LOC_Os02g51900.1LOC_Os02g51900
LOC_Os06g11720.1LOC_Os06g11720
LOC_Os08g07270.1LOC_Os08g07270
LOC_Os08g07200.1LOC_Os08g07200
LOC_Os10g17489.1LOC_Os10g17489
LOC_Os03g55010.1LOC_Os03g55010
LOC_Os03g55030.2LOC_Os03g55030
LOC_Os03g55030.1LOC_Os03g55030
LOC_Os03g55020.1LOC_Os03g55020
LOC_Os03g55050.1LOC_Os03g55050
LOC_Os03g55040.1LOC_Os03g55040
LOC_Os10g18480.1LOC_Os10g18480
LOC_Os10g18510.1LOC_Os10g18510
LOC_Os10g18530.1LOC_Os10g18530
LOC_Os04g44354.3LOC_Os04g44354
LOC_Os04g44354.1LOC_Os04g44354
LOC_Os04g44354.4LOC_Os04g44354
LOC_Os04g44354.2LOC_Os04g44354
LOC_Os02g42280.1LOC_Os02g42280
LOC_Os10g30560.1LOC_Os10g30560
LOC_Os05g41400.1LOC_Os05g41400
LOC_Os01g59110.1LOC_Os01g59110
LOC_Os10g12120.1LOC_Os10g12120
LOC_Os01g59100.1LOC_Os01g59100
LOC_Os03g48740.1LOC_Os03g48740
LOC_Os09g34214.1LOC_Os09g34214
LOC_Os09g34250.1LOC_Os09g34250
LOC_Os09g34270.1LOC_Os09g34270
LOC_Os09g34230.1LOC_Os09g34230
LOC_Os04g12980.1LOC_Os04g12980
LOC_Os04g12690.1LOC_Os04g12690
LOC_Os04g12960.1LOC_Os04g12960
LOC_Os04g12710.1LOC_Os04g12710
LOC_Os04g12970.1LOC_Os04g12970
LOC_Os04g12720.1LOC_Os04g12720
LOC_Os04g12950.1LOC_Os04g12950
LOC_Os04g12678.1LOC_Os04g12678
LOC_Os02g09510.1LOC_Os02g09510
LOC_Os05g47950.1LOC_Os05g47950
LOC_Os01g49240.1LOC_Os01g49240
LOC_Os01g49230.1LOC_Os01g49230
LOC_Os06g39330.1LOC_Os06g39330
LOC_Os02g10880.1LOC_Os02g10880
LOC_Os06g39270.1LOC_Os06g39270
LOC_Os11g04860.1LOC_Os11g04860
LOC_Os11g25990.1LOC_Os11g25990
LOC_Os05g08750.1LOC_Os05g08750
LOC_Os01g08440.1LOC_Os01g08440
LOC_Os06g18790.1LOC_Os06g18790
LOC_Os06g18670.1LOC_Os06g18670
LOC_Os06g18140.1LOC_Os06g18140
LOC_Os06g18010.1LOC_Os06g18010
LOC_Os01g50200.1LOC_Os01g50200
LOC_Os01g53390.1LOC_Os01g53390
LOC_Os01g53380.1LOC_Os01g53380
LOC_Os01g53370.1LOC_Os01g53370
LOC_Os01g53430.1LOC_Os01g53430
LOC_Os03g62480.1LOC_Os03g62480
LOC_Os05g45100.1LOC_Os05g45100
LOC_Os05g45110.1LOC_Os05g45110
LOC_Os10g07970.1LOC_Os10g07970
LOC_Os01g53460.1LOC_Os01g53460
LOC_Os05g45090.1LOC_Os05g45090
LOC_Os05g45080.1LOC_Os05g45080
LOC_Os05g45200.1LOC_Os05g45200
LOC_Os01g53330.1LOC_Os01g53330
LOC_Os06g23560.1LOC_Os06g23560
LOC_Os01g53350.2LOC_Os01g53350
LOC_Os01g53350.1LOC_Os01g53350
LOC_Os09g30980.1LOC_Os09g30980
LOC_Os09g30510.1LOC_Os09g30510
LOC_Os01g64910.1LOC_Os01g64910
LOC_Os05g45170.1LOC_Os05g45170
LOC_Os05g45140.1LOC_Os05g45140
LOC_Os05g45180.1LOC_Os05g45180
LOC_Os05g45150.1LOC_Os05g45150
LOC_Os01g53420.1LOC_Os01g53420
LOC_Os07g32630.1LOC_Os07g32630
LOC_Os07g32620.1LOC_Os07g32620
LOC_Os07g32020.1LOC_Os07g32020
LOC_Os07g32060.1LOC_Os07g32060
LOC_Os07g32010.1LOC_Os07g32010
LOC_Os07g31960.1LOC_Os07g31960
LOC_Os07g37690.1LOC_Os07g37690
LOC_Os02g14680.1LOC_Os02g14680
LOC_Os02g14630.1LOC_Os02g14630
LOC_Os02g14590.1LOC_Os02g14590
LOC_Os02g14570.1LOC_Os02g14570
LOC_Os02g14540.1LOC_Os02g14540
LOC_Os01g43280.1LOC_Os01g43280
LOC_Os01g43270.1LOC_Os01g43270
LOC_Os11g38650.1LOC_Os11g38650
LOC_Os05g12450.1LOC_Os05g12450
LOC_Os07g46610.1LOC_Os07g46610
LOC_Os04g46970.1LOC_Os04g46970
LOC_Os04g47770.1LOC_Os04g47770
LOC_Os04g47720.1LOC_Os04g47720
LOC_Os04g46990.1LOC_Os04g46990
LOC_Os04g46980.1LOC_Os04g46980
LOC_Os05g42070.1LOC_Os05g42070
LOC_Os05g42020.1LOC_Os05g42020
LOC_Os05g42060.1LOC_Os05g42060
LOC_Os05g42040.1LOC_Os05g42040
LOC_Os03g59350.1LOC_Os03g59350
LOC_Os03g53350.1LOC_Os03g53350
LOC_Os03g46400.1LOC_Os03g46400
LOC_Os05g08510.1LOC_Os05g08510
LOC_Os01g45140.1LOC_Os01g45140
LOC_Os01g41450.1LOC_Os01g41450
LOC_Os01g41430.1LOC_Os01g41430
LOC_Os01g45110.1LOC_Os01g45110
LOC_Os03g11350.1LOC_Os03g11350
LOC_Os01g66620.1LOC_Os01g66620
LOC_Os04g44250.1LOC_Os04g44250
LOC_Os04g44240.1LOC_Os04g44240
LOC_Os05g08480.1LOC_Os05g08480
LOC_Os10g09990.1LOC_Os10g09990
LOC_Os01g08080.1LOC_Os01g08080
LOC_Os02g11700.1LOC_Os02g11700
LOC_Os06g10860.1LOC_Os06g10860
LOC_Os08g07170.1LOC_Os08g07170
LOC_Os08g07180.1LOC_Os08g07180
LOC_Os06g11710.1LOC_Os06g11710
LOC_Os07g13780.1LOC_Os07g13780
LOC_Os02g11680.1LOC_Os02g11680
LOC_Os02g11670.1LOC_Os02g11670
LOC_Os02g11640.1LOC_Os02g11640
LOC_Os02g11130.1LOC_Os02g11130
LOC_Os02g11110.2LOC_Os02g11110
LOC_Os02g11110.1LOC_Os02g11110
LOC_Os03g24430.1LOC_Os03g24430
LOC_Os05g08490.1LOC_Os05g08490
LOC_Os01g08110.1LOC_Os01g08110
LOC_Os01g08090.1LOC_Os01g08090
LOC_Os01g08100.1LOC_Os01g08100
LOC_Os04g55680.1LOC_Os04g55680
LOC_Os06g17260.1LOC_Os06g17260
LOC_Os06g17140.1LOC_Os06g17140
LOC_Os06g17090.1LOC_Os06g17090
LOC_Os06g17110.1LOC_Os06g17110
LOC_Os06g17120.1LOC_Os06g17120
LOC_Os06g17250.1LOC_Os06g17250
LOC_Os06g17020.1LOC_Os06g17020
LOC_Os08g38110.1LOC_Os08g38110
LOC_Os08g38160.1LOC_Os08g38160
LOC_Os08g38130.1LOC_Os08g38130
LOC_Os06g08830.1LOC_Os06g08830
LOC_Os06g39080.1LOC_Os06g39080
LOC_Os06g39070.1LOC_Os06g39070
LOC_Os04g20360.1LOC_Os04g20360
LOC_Os03g30934.3LOC_Os03g30934
LOC_Os03g30934.5LOC_Os03g30934
LOC_Os03g30934.4LOC_Os03g30934
LOC_Os03g30934.2LOC_Os03g30934
LOC_Os03g30934.1LOC_Os03g30934
LOC_Os04g12669.1LOC_Os04g12669
LOC_Os04g04240.1LOC_Os04g04240
LOC_Os04g25820.1LOC_Os04g25820
LOC_Os04g24840.1LOC_Os04g24840